1.病原体污染时首先应采取的对策
1.1 掌握污染情况
1.1.1 实验动物被病原体污染时，首先必须了解病原体在群体中的污染程度即群体内动物的感染率(感染个体数／群体动物数)和抗体阳性率(抗体阳性动物数／被检测的群体动物数)。
1.1.2 调查从新动物的引入与繁殖等各个环节来推测感染是否存
在。
1.1.3 根据病原体在动物群体内的潜伏期的易难，感染高峰过后，如果抗体阳性增多，是否可从动物群体中消灭该病原特征。例如污染仙台病毒，在短时间内的扩大感染，几乎所有动物个体抗体转阳性，从个体清除病毒到群体动物病毒的消失。相反，霉形型病灶在肺中长期生存，从呼吸道不断排出，作为持续传染源，在动物群体中长期存在。感染球虫的家兔，不断地排出卵囊，反复自身感染，不能排除污染。病原体污染，首先要确定感染情况，防止感染的继续扩大。
1.1.4 根据轻重缓急，采取相应的处置措施。
1.2处置污染措施
1.2.1从污染室搬出的东西，都必须进行灭菌。
1.2.2 由专门人员进出污染室，这些成员不许接触其他动物，也严禁其他成员出入污染饲育室。
1.2.3 对已准备作为实验群用的动物，原则不得再使用。
1.2.4 由感染动物上取得的实验材料，如血液脏器和细胞等，因可造成新的动物群体感染流行，原则上不得使用。
1.3 找出污染原因
1.3.1 隐性感染动物引进所致：引入动物，要加强验收、检疫，及时发现病原感染动物。可是要切实实施却很困难，因为依赖于观察症状的检疫，几乎很难发现隐性感染动物，因此极难防备。污染的原因多半是由引入感染动物引起，特别是隐性感染动物最危险，没有定期进行微生物监测的动物，就不应该引进。
1.3.2 使用污染的实验材料：例如在污染动物上传代的肿瘤细胞，污染动物的脏器或其它生物制剂。如果动物接种污染的实验试剂，将引起新的污染，由传代肿瘤细胞的应用引起的污染的事件很多，必须引起研究者注意。
1.3.3 野生动物的侵入：由于动物设施构造上的缺陷，以及设施的破损，常导致野生动物，特别是鼠类的侵入，由于未发现入侵动物，而忽视的情况是很多的，从而出现与输入隐性感染，动物一样的结果。可以认为动物的未知病原微生物的隐性感染，不仅对动物，对人的影响可以说危险性更大。
1.3.4 用具、设备的缺陷以及操作的失误：上述是与动物直接有关造成的污染，然而用具设备的缺陷，也常造成污染蔓延，这是要考虑的另一个原因。用具设备的缺陷、操作的失误等，造成病原微生物侵入或感染在饲养室反复传播，影响很大。
1.3.5 灭菌或消毒不当：因高压灭菌条件不合适，造成灭菌不完全，不按操作规程操作。
1.3.6 饮水污染：使用集中化纯水供应系统的场合，由于过滤器使用时间过长，过滤效率降低，或者因为末端剩水未定期放进而造成水源污染。
1.3.7 人员流程不当：从污染动物室进入清洁动物室，灭菌物与污染物保管界限不清等都可造成各种事故。
1.3.8 空气倒流或过滤器过滤不彻底：因送风量小于排风量而出现空气倒灌，或因空气过滤器安装不严密或有污染空气进入屏障设施。
1.3.9 发生污染事故后，要反复查找每个操作方法、程序、用具设备状况，有无偷懒情况或操作不当之处，并加以纠正。
2. 污染动物的一般处置
2.1处死或其它处理：对因污染引起的实验动物疾病，总的来说是不进行治疗的，通常以处死或进行一般处理为原则。
2.2 使用药物治疗：对小鼠和大鼠的蛲虫、兔子的球虫、耳癣等寄生虫或原虫病可使用药物治疗，这样就可推迟净化。
2.3 改善饲养条件：若绿脓杆菌的污染，可在饮水中加氯或盐酸加以解决，这种办法可认为是一种治疗，也可认为是改善饲养条件。
3.污染饲养室的净化
3.1 净化原则污染后饲养室的净化，要根据污染病原体的种类特性，选择有针对性的净化方法，如仙台病毒、小鼠肝炎病毒和巴斯德氏菌等病原体，在环境中的抵抗力比较弱，用一般的消毒药喷雾即可抗力强的轮状病毒、支气管败血性菌和绿脓杆菌，可使用杀菌强的消毒药，或合并使用作用强的甲醛熏蒸，污染球虫和蛲虫等产生的虫卵或卵囊，可用对这些有效的热水或蒸汽烫，或用机械方法清洗，以下叙述最普通的消毒剂喷雾和甲醛熏蒸。
3.2 消毒药的喷雾
3.2.1 消毒药喷雾前，必须尽可能把室内的污物清洗干净。
3.2.2 喷雾操作者必须戴手套和防毒面具，如能使用自动喷雾器，则更方便。
3.2.3 常用的消毒药有氯化铵、次氯酸钠、碘剂和洗必泰等。
3.2.4 喷雾量:杀灭表面附着菌一般为30ml／m3，杀灭空气中浮
游菌一般为（6.5-10ml)／m3。
